DFT

QE错误S matrix not positive definite

QE中出现错误：

Error in routine cdiaghg (xxx):
   S matrix not positive definite"

这个可能是赝势文件的问题，更换赝势试试。

QE用intel mpi编译

因为默认查找的mpi fortran编译器是mpif90，而intel mpi中这个脚本调用的是gfortran。所以干脆把mpif90干掉，复制一个mpiifort好了。

配置中有一个scalapack，默认使用的是openmpi的，改成用intel的。

链接指令LDFLAGS可以加上-mkl让其找到fftw库。

cif文件转坐标

因为cif文件中是空间群的信息，从中直接计算坐标比较麻烦，可以使用VESTA软件打开后另存为xyz文件。